多个变量和一个变量的相关性(多变量两两相互关系联合分布图的Python绘制)
本文介绍基于Python中seaborn模块 ,实现联合分布图绘制的方法 。
联合分布(Joint Distribution)图是一种查看两个或两个以上变量之间两两相互关系的可视化图 ,在数据分析操作中经常需要用到 。一幅好看的联合分布图可以使得我们的数据分析更加具有可视性 ,让大家眼前一亮 。
那么 ,本文就将用seaborn来实现联合分布图的绘制 。seaborn是一个基于matplotlib的Python数据可视化模块 ,借助于其 ,我们可以通过较为简单的操作 ,绘制出各类动人的图片 。
首先 ,引入需要的模块 。
import pandas as pd import seaborn as sns接下来 ,将存储有我们需要绘制联合分布图数据的文件导入 。因为我是将数据存储于.csv文件 ,所以我这里用pd.read_csv来实现数据的导入 。我的数据在.csv文件中长如下图的样子 ,其中共有107行 ,包括106行样本加1行列标题;以及10列 。我们就看前几行即可:
导入数据的代码如下:
data_path="G:/black_carbon_paper/97_BC20201230/00_Original/AllData5Factor.csv" column_names=[FID,ID,X,Y,BC,Temp,Slope,RoDen,POI,GAIA] my_data=pd.read_csv(data_path,names=column_names,header=0)其中,data_path是.csv文件存储位置与文件名 ,column_names是导入的数据在Python中我希望其显示的名字(为什么原始数据本来就有列标题但还要再设置这个column_names ,本文下方有介绍);header=0表示.csv文件中的0行(也就是我们一般而言的第一行)是列标题;如果大家的初始数据没有列标题,即其中的第一行就是数据自身 ,那么就需要设置header=None 。
执行上述代码 ,我们将导入的数据打印 ,看看在Python中其长什么样子 。
print(my_data)可以看到 ,导入Python后数据的第7列 ,原本叫做Slope_1 ,但是设置我们自己命名的column_names后 ,其就将原本数据的列标题改为我们自己设定的标题Slope了 。如果我们不设置column_names ,导入的数据就是这个样子:
可以看到 ,我们不用column_names的话 ,数据导入Python后列名就是原始的Slope_1。
我们继续 。其实用seaborn绘制联合分布图非常简单(这就是seaborn对matplotlib改进 ,让我们绘制复杂的图时候不需要太麻烦) ,仅仅只有一下两句代码:
joint_columns=[BC,Temp,Slope,RoDen,POI,GAIA] sns.pairplot(my_data[joint_columns],kind=reg,diag_kind=kde)其中,第一句是定义我们想要参与绘制联合分布图的列 ,将需要绘图的列标题放入joint_column 。可以看到 ,因为我的数据中,具有ID这种编号列 ,而肯定编号是不需要参与绘图的 ,那么我们就不将其放入joint_column即可。
第二句就是绘图 。kind表示联合分布图中非对角线图的类型 ,可选reg与scatter 、kde 、hist ,reg代表在图片中加入一条拟合直线 ,scatter就是不加入这条直线,kde是等高线的形式 ,hist就是类似于栅格地图的形式;diag_kind表示联合分布图中对角线图的类型 ,可选hist与kde ,hist代表直方图 ,kde代表直方图曲线化 。
以kind和diag_kind分别选择reg和kde为例 ,绘图结果如下:
以kind和diag_kind分别选择scatter和hist为例 ,绘图结果如下:
个人感觉第一幅图好看些~
不过 ,由于参与绘图的变量个数比较多,因此使得图中的字体有点看不清 。可以加上一句代码在sns.pairplot这句代码的上面:
sns.set(font_scale=1.2)其中 ,font_scale就是字体的大小 ,后面的数字越大,字体就越大 。以font_scale=1.2为例 ,让我们看看效果:
这样子字体就大了~
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